Annie Mutamba a débuté sa carrière à Washington, au sein du Africa Policy Information Center – la plus ancienne organisation aux États-Unis dédiée aux questions africaines. Elle se spécialise ensuite en affaires européennes et est en charge pendant 10 ans de programmes de communication institutionnelle au sein du Conseil Européen de l’Industrie Chimique à Bruxelles. En 2013, elle fonde le premier cabinet de conseil en affaires publiques européennes spécialisé dans les relations Europe-Afrique.